A Klónosztagosok genetikailag módosított, mozgatható katonai egységek voltak a Klónháborúban, sőt, a háború egyik legmegismertebb részeiként használták fel őket. A távoleső Kaminó bolygón kezdték meg a sorozatos gyártásaikat egy mintaegyed véréből kezdve, hogy hatékony katonai erők lehessenek, a Galaktikus Köztársaság részére. A háborút mozgató szeparatisták veszteségére a katonákat kiválóan tudták beosztani, hisz korlátlan mennyiségben állították elő őket.

A rejtélyes Nabooi blokád előtt még kis idővel a titokzatos Syfo-Dyas Jedi mester megrendelésére a Kaminói klónozó technikusok belekezdtek egy hatalmas projektbe, amely ugyan rengeteg pénzt emésztett fel, de ezzel tudták kamatoztatni a képességeiket. A mintaegyed a mandalóri fejvadász, Jango Fett személye volt, mivel Fett kiváló képeséggel rendelkezett ahhoz, hogy egy ideális hadsereget készítsenek belőle. Később Dooku gróf felkereste és megölte Dyas mestert, de erről a kaminóiak mitsem sejtve, nem szakították meg a nagy köztársasági-projektet, ezért egy évtized múlva már több zászlóaljnyi osztag került ki, kemény körülmények között.

A klónokat éltető tartályokban növesztik meg, az újszülötteket mesterséges körülmények között etetik/itatják, megfelelő körülményeket biztosítanak nekik. A gyorsított fizikai, szellemi és érzelmi növekedés miatt a klónok könnyen váltathatnak ki pszichés problémákat, de ezeket később módosították a technikusok. Amikor fizikálisan elérik a tízéves kort, a klónok már teljesen kifejlett emberi életkorúak, emiatt sajnos igen rövid életutat járhatnak be, de alig pár évtizedes életük alatt rengeteget szolgálhatnak a megbízóiknak, a Köztársaságnak.

A klónok kiskorukban igen sterill körülmények között tanulnak és képzik magukat ki, keményen. A kaminóiak rendkívül figyelnek arra, hogy a klónozóbázis körül nagy tisztaság és rend legyen, az újszülött "egységek" véletlenül se szennyeződjenek be. Ezt az egyensúlyt igen nehéz betartani. A klónokat igen nehéz körülmények között lehet csak harctérre küldeni, sok katonai gyakorlaton kell átesniük. Hagyományos páncélzatuk alapszíne fehér, ütésálló lemezek borítják a mellpáncélt és a lábszárvédőket. A sisakjuk a háborúk alatt sokat ment át egyéb formális változásokon. A sisakok eleinte T-alakú arcvédő lemezzel és kilátóval lettek felszerelve, de ezeket is később tovább modernizálták.

A klónosztagosok kétféle plazmafegyvert alkalmaznak. Az előírt, szabványos sugárvetőkhöz képest ezek is plazmasugarat állítanak elő, kis mennyiségű tibanna gázból. A sugárfegyvernek megvan az előnye, hogy az osztagosoknak nem kell pót-töltényeket használni, bár nehezebb velük célozni és bemérni a célpontot, a sugár instabillitása miatt. És bár kisebb a hatótávolsága, remekül tudták kezelni őket az elkövetkezendő háború standardévekben.

A hagyományos fehér páncélzat az elmúlt évek során sokat fejlődött. A klónosztagosoknak saját beosztásai vannak, mint pl. a parancsnok, a hadnagy stb. Ezeket a rangokat a páncélzat színén jelzik, általában piros csíkkal övezik a sisak kupoláját és fegyverzetük is tiszteletet élvez. A katonákat később tovább képezték, az elitosztagosok elit körülmények között, spártai életmódhoz hasonlóan nevelkednek, amelnyek az eredménye hatásos, a klónok igen elkötelzetettek és legendásan lojálisak. A legtöbb klónparancsnok általában elitosztagos, genetikailag tovább modernizált. Az osztagosok másik részét a Klónpilótákat nem harci viszonyokra gyártották, hanem a légi bevetésekre.

Zam Wessel fejvadász meggyilkolása után Obi-Wan Kenobi Jedi mester 21 évvel a yavini csata előtt, a gyilkos méregtű után kezdett kutatni, végül meg is találta az eredetét, a Kamino bolygót. A kis planétán aztán hamar elámult az elétáruló klónhadsereg látványától, ugyanis ezek az egységek lesznek a Köztársaság elkövetkezendő éveiben a döntőkulcs a végső győzelemben, a szeparatisták és a bürokraták ellen. A klónosztagosok egyébként azért is előnyösebbek, mint egy harci droid, mivel a klónokat genetikailag lehet befolyásolni, agykapacitás téren is. A szeparatista rohamdroidok előállítása még drágább és költségesebb volt, mivel csak egy parancsot tudtak végrehajtani, azt is egy központi terminál vezérlésével is.

Mikor Obi-Want, Anakint és Padmé szenátornőt fogságba ejtették a Geonosison, ahol kémkedtek a megalakuló Független Rendszerek Konföderációja ellen, a szeparatista vezetők azonnali kivégzést követeltek a három elítéltnek. A helyi arénában került sor erre, ám a páholyban és a nézősorban több mint 200 Jedi mester és padawan jelent meg, hogy kiszabadítsák a hármast és véres harc kezdődött.  Ám ekkor az égbolton több tucatnyi teherszállító klónzászlóalj érkezett meg, megtisztítva az ellenséges területet. Ezzel megkezdődött a klónok háborúja! A szeparatista vezetők azonnal dezertáltak.

A Klónháborúban megkezdődött a Jedik és a Köztársaság kérésére a klónozás megkétszerezése, mert a háború alatt a szeparatisták ezernyi bolygót és rendszert szálltak meg és a bevetésekben milliárdnyi klónegység halt meg, hősi módon. A szakadár vezérek szülőhazáin kívül rengeteg bolygón kezdődött meg a véres harcok kezdete. Kashyyyk, Felucia, Saleucami... némely bevetéseken különleges páncélzattal ellátott egységeket vetettek be, például a Delta osztagot, egy speciális alakulatot, amely tagjai Katarn páncélzatot viseltek, ezt a felszerelést viszonylag nehezen lehett megsebezni, bár hátránya a lassú mozgás volt.

A Delta osztagon kívül a másik nagy kommandó az ARC (Advenced Recon Commando) osztag volt, egy preczíen tovább fejlesztett hadsereg. Az ARC már csak azért is egyedi, mivel nem csak a páncélzat és a fegyver a döntőszó, hanem saját gondolkodásmóddal és cselekvőképességel lettek előállítva. Az ARC ritka számban fordult elő, ilyen típusúakat vetettek be a Muunilinsti-csatában, ahol rengeteg estek el, de sikerült megfékezni a muunok és a Bank Klán lázadozását. Az ARC jelzései szerint a zöld színű egység elitosztagos, a kék hadnagyi és a piros/sárga színű osztagos kapitányi vagy parancsnoki rangot és előnyt élvez. Bár a klónok nem rendelkeznek saját névvel, a gyártók számmal és kóddal jelölik meg őket, de a parancsnokok saját nevet kaphatnak: ilyen volt a Felucián teljesítő Bly parancsnok, a Saleucamin ténykedő Neyo vagy az Utapau-rendszerben szolgáló Cody.

A háború utolsó standard hónapjaiban Palpatine főkancellár védelmét megduplázták, ugyanis a Köztársaság vezetője több merényletnek volt kitéve, ilyen volt például Grievous tábornok esete, amikor a szeparatista cyborg-humán elrabolta. A háborúban részt vett bolygók nagy részén a szeparatista állomások megszűntek, mivel a klónok előrébb nyomultak, a Konföderáció már csak az igazi nagyhatalmi bolygón tudtak megmaradni, pl. Cato Neimoidia, Kashyyyk és a Peremvidéki bolygók zöme. Végül már a külső rendszerből is sikerült kivonni a szeparatistákat.

Az igazságra 19 BBY-ben került fény: a klónokat a 66-os parancsra készítették, egy igazán nagy Jedi pusztító parancsra, amellyel a Rend százait mészárolták le, amint Darth Sidious kiadta az utasítást. A klónok sosem tisztelték vezetöiket, és sosem éreztek különösebb elkötelezettséget, Sidious nagyurat segítve. Rengeteg Jedi halt  meg, Ki-Adi-Mundi, Barris Offee, Aayla Secura, Luminara Unduli, Plo Koon... és rajtuk kívül még sok tucat mester, harcokat vívva más világokon.

A Galaktikus Birodalom fénykorában még pár száz zászlóalj ugyan fennmaradt, de a klónok a rövid életkoruk miatt - ez genetikai beállítottság - hamarosan kihalni kezdtek, a maradékok páncélzatát átalakították és új nevük a rohamosztagos lett (lásd később a rohamosztagos cím alatt levő cikket...). A szeparatista maradékokat az 501-es Légió segítségével kiírtották és az új, igazi hatalom a Birodalom lett, az álnok és zsarnok Palpatine - immár császár - által.

A Birodalom fénykorában, tehát 0 BBY körül, a klónok jószerivel teljesen kihaltak és a projekt is abbamaradt, mivel a Kaminói klónüzemet elpusztították. A birodalmi hadsereget már csak igazi, nem geneteikai vagy valami egyéb mesterséges emberek alkották. Bár ezek jóval gyengébb minőségű páncélzatot és fegyvert alkalmaztak, hatalmas létszámban fordultak meg a Galaxisban, a birodalmiak jelképeként. Darth Vader és Palpatine császár halálával az Endori csata után még megpróbálták a klónozási projeketet újra, de a birodalmi tudósok nem találták meg a megfelelő szerét ennek, ezért továbbra is csak az emberi hadsereg maradt meg.